The Assassin's Creed франчайзът винаги е разказвал своята история от гледна точка на Ордена на убийците. С Ордена на тамплиерите, който защитава мира чрез премахване на свободната воля, винаги е било ясно кой е прав. Има обаче едно заглавие, което демонстрира перспективата на Ордена на тамплиерите - и как един френч едва не унищожи Колониалното братство на убийците.
Assassin's Creed Rogue представи млад убиец на име Шей Патрик Кормак, който беше член на Американското братство точно преди Седемгодишната война. Той и неговият приятел Лиам О'Брайън имаха задача да ловят артефакти, за които Орденът смяташе, че са обвързани с Райски парчета. Те съществували много преди раждането на Символа на вярата и притежавали такава велика сила, че ако тамплиерите придобият контрол дори над един от тях, те биха могли да поробят цялото човечество.
Двойката успя да намери един артефакт в древен храм под Лисабон. Въпреки това, Шей, който го взе, предизвика земетресение, което уби и заседна хиляди. Това преживяване го накара да вярва, че убийците не се интересуват от невинните, сега ги разглеждат като противоположност на героите, които той е смятал. Шей обърна гръб на Ордена, излагайки живота си на риск, докато сътрудниците го ловуваха. В крайна сметка той намери пътя си към колониалния ритуал на Ордена на тамплиерите и оттам застана на страната на заклетия враг на убиеца и се зарече да попречи на старите си сътрудници да намерят някога друг храм.
По време на Седемгодишната война Шей преследва старите си партньори-убийци с тамплиерския гросмайстор Хайтъм Кенуей. Хейтъм е син на пиратския убиец Едуард Кенуей, но той е отгледан да следва тамплиерите. През годините Хайтъм и Шей се утвърдиха в колониите и спечелиха Седемгодишната война за тамплиерите. Той също така елиминира някои от най-мощните членове на Колониалното братство.
Кулминацията на Assassin's Creed Rogue видя как Шей убива стария си приятел Лиъм и Хейтъм, осакатявайки техния лидер Ахил Давънпорт. В продължение на седем години Асасините бяха дезорганизирани и без лидерство, тъй като Шей и тамплиерите контролираха колониите от сянка. Няма да минат още седем години, докато синът на Хайтъм Конър ще пристигне и ще продължи там, където Ахил е спрял, като елиминира заплахата на тамплиерите в Америка и помага за победата на страната срещу британската корона по време на един от най-важните конфликти в историята, Американската революция
Кормак продължи да работи с Ордена на тамплиерите, търсейки древни артефакти, които да им помогнат да спечелят предимство срещу убийците. Докато Конър продължаваше да освобождава колониите, Шей беше в Париж със задача да убие убиец, който държеше свещена кутия, която можеше да отключи древни тайни и съществуваше още от китайския убиец Шао Юн. Убиецът, който той уби, беше бащата на Арно Дориан, убиец, който щеше да помогне за освобождаването на Париж през Assassin's Creed Unity . Въпреки че Шей Кормак не унищожи изцяло Американското братство на убийците, той показа колко бързо те могат да се разпаднат, когато някой от тях премине настрана.
