ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ: Следната статия съдържа спойлери за Отминалите дни .
След около 40 часа геймплей, за да завършат основната история, много геймъри ще оставят своите контролери настрана и ще си тръгнат Отминалите дни за добро . Други ще стартират изцяло нов файл за запазване. Въпреки това, тези, които продължават да играят след кредитите, ще бъдат възнаградени с таен край, който има огромни последици.
След като финалната мисия приключи и Wizard Island бъде унищожен, картата на отворения свят на играта все още е на разположение за роуминг. Оттам нататък играчите могат да завършат всички останали странични цели, като Freaker Hordes или NERO изследователски сайтове. След известно време играчът ще получи радио съобщение от изследователя на NERO Джеймс О'Брайън, който ще помоли играча да се срещне с него.
Когато главният герой дякон Сейнт Джон среща О'Брайън на старото гробище, нещата стават луди. В пролога играчът се среща с О'Брайън, който е облечен в пълен костюм за хазмати и каска с прозрачен екран. Тук се вижда лицето му. През останалата част от играта обаче маската на O’Brian е оцветена, което означава, че Deek не може да види лицето му.
Причината за това е разкрита само в катсцена на тайния край: О'Брайън е заразен. Накрая сваля маската си, за да разкрие отвратително, съдово виждане, което кара Дийкън да отстъпи. О'Брайън обяснява, че вирусът, създал Freakers, бързо се развива и вече е на етап, в който може да нахлуе в лимфната система (която помага да се предпази тялото от болести и инфекции) на незаразени хора. Той също така разкрива, че висшите служители в NERO знаят за това от известно време и предупреждава Дийкън, че идват. О'Брайън си тръгва, скачайки във въздушен хеликоптер с нечовешка сила и пъргавина.
Този кътсцен показва, че този нов щам на вируса създава изцяло нова форма на Freaker, която поддържа когнитивните функции на човека, но притежава силата, скоростта и агресията на съществата, с които се бори Дякон Отминалите дни . Всъщност в няколко точки от тази сцена тялото на О'Брайън прави привидно неволни дръпвания и той дори прави няколко стъпки към Дийк, преди да се извини. Въпреки че никога не е изрично посочено, изглежда О'Брайън се противопоставя на биологичното желание за атака, породено от вируса.
Ясно е, че тази сцена имаше за цел да остави вратата отворена за Отминалите дни продължение, нещо, което сега изглежда така, сякаш никога няма да се случи. Вместо оптимистичния завършек на Дийк, който язди в залеза със Сара, този обрат завърши играта на по-тъмна, по-заплашителна нота. Новата форма на Freaker, въведена чрез O'Brian, би създала страховит враг във втора игра, която със сигурност щеше да последва усилията на Deacon да разкрие истината за връзката на NERO с вируса.
Струва си да се отбележи, че въпреки че NERO има видно място Отминалите дни , Дякон никога всъщност не се бие срещу тях. В мисиите, в които са включени, Дийк може да се прокрадва само около войниците и изследователите, тъй като играта ясно показва, че костюмите им са твърде укрепени, за да може той да прореже или стреля. Едно продължение вероятно щеше да направи NERO главния антагонист, като Дийкън и компания трябваше да се изправят срещу тях челно. Както обаче стоят нещата, това е история, която ще остане неизказана.
